Η Έφη Φωτακίδου ολοκλήρωσε τις προπτυχιακές σπουδές της στην Οδοντιατρική Σχολή του Α.Π.Θ. το 2008 και την ίδια χρονιά αποφοίτησε από τη Στρατιωτική Σχολή Αξιωματικών Σωμάτων Θεσσαλονίκης (Σ.Σ.Α.Σ.) με το βαθμό της Ανθυπολοχαγού Υγειονομικού Οδοντιάτρου.

Σπούδασε στο τριετές πρόγραμμα ειδίκευσης στο Center for Advanced Dental Education του Saint Louis, MO στις Η.Π.Α. απ’ όπου αποφοίτησε το 2015 ως ειδικός ορθοδοντικός μετά την εκπόνηση της διπλωματικής της (MSc). To 2018 πέτυχε στις εξετάσεις ειδικότητας της Ορθοδοντικής του Υπουργείου Υγείας και είναι Επιμελήτρια στην Ορθοδοντική κλινική του 401 Γ.Σ.Ν.Α. Είναι μέλος του Οδοντιατρικού Συλλόγου Αθηνών, της Εταιρείας Ορθοδοντικής και Γναθοπροσωπικής Μελέτης και Έρευνας και παρακολουθεί το μεταπτυχιακό πρόγραμμα Επιδημιολογίας και Μεθοδολογίας της Έρευνας της Ιατρικής Σχολής του ΕΚΠΑ. Είναι συνεργάτης του Dental-Eye Project από το 2020 και ασκεί όλο το φάσμα της ορθοδοντικής παιδιών, εφήβων και ενηλίκων, ενώ είναι πιστοποιημένη στο σύστημα Invisalign που αφορά σε διαφανείς ορθοδοντικούς νάρθηκες καθώς και στο σύστημα γλωσσικών ορθοδοντικών αγκίστρων WIN.